原理是利用rdkit的EDKDG方法生成一大批初始构象,然后调用MMFF94力场进行优化和能量计算,然后进行能量和结构RMSD的去重,最后进行排序和玻尔兹曼分布计算,得到可能性大于1%的所有构象。
如果你不知道什么是smiles,可以在ChemDraw中绘制好分子结构后,右键,选择"Molecule" → "Copy As" → "SMILES"即可复制smile式